La microbiota está estrechamente relacionada con la salud mental a través del "eje microbiota-intestino-cerebro", ya que los microorganismos intestinales pueden influir en la función cerebral mediante vías como la producción de neurotransmisores, la regulación del sistema inmunológico y la estimulación del nervio vago. Un desequilibrio en la microbiota se asocia con un mayor riesgo de trastornos como la depresión, la ansiedad y el estrés.